Фонд реализует программы в области сохранения водных ресурсов, сохранения биоразнообразия, развития устойчивого туризма и экологического образования.
В пуле проектов Фонда – комплексная программа по изучению байкальской нерпы, грантовая поддержка ученых, занимающихся исследованием исчезающих и редких видов растений и животных на Байкальской природной территоррии, собственные исследования состояния экосистемы озера Байкал, внедренные проекты по раздельному сбору отходов на особо охраняемых природных территориях.
Фонд участвует в работе экспертных сообществ по совершенствованию природоохранного законодательства Российской Федерации, а также является аккредитованным членом ЮНЕПа и Всемирного водного совета.